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Examinando por Autor "Rinaudo, Mariangel"

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    Complete sequence of a blaNDM-1-harboring plasmid in an Acinetobacter bereziniae clinical strain isolated in Argentina
    (American Society for Microbiology, 2015-10) Brovedan, Marco Alcides; Marchiaro, Patricia M.; Morán-Barrio, Jorgelina; Cameranesi, Marcela; Cera, Gabriela; Rinaudo, Mariangel; Viale, Alejandro M.; Limansky, Adriana S.
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    Klebsiella pneumoniae hipermucoviscosa: caracterización fenotípica y estudio de marcadores genéticos de hipervirulencia
    (2023-12-14) Martínez, Cecilia Anahí; Rinaudo, Mariangel; Marchiaro, Patricia
    Klebsiella es un género que incluye bacterias Gram negativas, anaerobias facultativas, que se aisló por primera vez a finales del siglo XIX y su nombre es en honor al microbiólogo alemán Edwin Klebs. Klebsiella se clasifica dentro de la familia Enterobacteriaceae la cual contiene una gran variedad de géneros considerados patógenos humanos, entre ellos, Salmonella, Yersinia, Serratia, Enterobacter, Citrobacter, Kluyvera, Leclercia, Raoultella, Cronobacter, entre otros. Al presente, el género Klebsiella comprende al menos 27 especies incluidas las pertenecientes al complejo de especies de K. pneumoniae (KpSC) y otras especies de Klebsiella (e.g. K. indica, K. terrigena, K. spallanzanii, K. huaxiensis, K. oxytoca, K. grimontii, K. pasteurii y K. michiganensis). La secuenciación del genoma completo, metodología de elección para definir una especie bacteriana, permitió identificar siete filogrupos que pertenecen a KpSC, incluidos K. pneumoniae, K. quasipneumoniae subesp. quasipneumoniae, K. quasipneumoniae subsp. similipneumoniae, K. variicola subsp. variicola, K. variicola subsp. tropica, K. quasivariicola y K. africana. Entre las especies del complejo, K. pneumoniae sensu stricto es la especie prevalente en muestras clínicas y normalmente comprende ~85% de los aislamientos identificados como K. pneumoniae (Kp). Todas las especies del complejo suelen ser erróneamente identificados como K. pneumoniae al utilizar métodos fenotípicos (pruebas bioquímicas) o proteómicos, debido a que poseen características similares. Alternativamente, la secuenciación de determinados genes housekeeping (e.g. gyrA) permiten también identificar las especies del complejo, no obstante, la secuenciación no es una metodología de rutina en el laboratorio clínico. Los métodos modernos de identificación bacteriana de especies incluyendo los secuenciadores y los espectrómetros de masa (MALDI-TOF) realizan análisis comparativos con genomas o cepas de referencia, y requieren bases de datos actualizadas para reflejar una taxonomía precisa. En Argentina, numerosas instituciones de salud han incorporado la técnica de MALDI-TOF al laboratorio clínico. Es así, que en el 2015 se creó la Red Nacional de Identificación Microbiológica por Espectrometría de Masas (RENAEM), la cual aporta actualizaciones para la identificación entre los que encuentra el género Klebsiella. Los estudios epidemiológicos en una población de aislamientos del complejo K. pneumoniae pueden realizarse por la metodología de secuenciación de múltiples alelos incluyendo el análisis filogenético de numerosos genes cromosomales (cgMLST, por core-genome multilocus sequence typing), o alternativamente de 7 genes housekeeping según el esquema propuesto por Pasteur. Estos análisis permiten definir sequenciotipos (ST) o clones, así como grupos clonales (CG) con ST estrechamente relacionados en estudios poblacionales. [...]
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    Nuevos enfoques en el estudio de las infecciones causadas por especies del género Aeromonas: relevancia clínica de la identificación y de la resistencia antimicrobiana
    (2021) Rebagliati, Juan Daniel; Colombo, Laura; Rinaudo, Mariangel
    La identificación de especies del género Aeromonas ha sido y continúa siendo compleja debido a la aparición de nuevas especies y a la reclasificación de especies existentes. Si bien la identificación a nivel de género por los distintos métodos resultó ser confiable según nuestro estudio, muchos de ellos tienen sus limitaciones en relación a la identificación a nivel de especie. Es importante considerar que A. dhakensis fue la especie que aislamos con mayor frecuencia, fundamentalmente en pacientes con infecciones de piel y partes blandas, asociadas principalmente a traumatismos ocurridos con exposición al medio ambiente, sobre todo accidentes en la vía pública. Esta especie no se encuentra incluida actualmente en la base de datos de los métodos automatizados de nuestro país (MALDI-TOF, VITEK® 2), por lo que puede identificarse erróneamente, siendo necesaria la genotipificación, técnica poco accesible a laboratorios de baja y mediana complejidad. La identificación por pruebas bioquímicas convencionales siguiendo el esquema Aerokey II modificado mostró buena concordancia con el método de referencia. Los aislamientos identificados por secuenciación del gen gyrB, fundamentalmente de A. dhakensis, podrían ser utilizados en la actualización de la base de datos de MALDI Biotyper ya que la ampliación en el análisis de espectros es una de las mejoras que se implementan desde el Laboratorio Nacional de Referencia. El presente estudio generó un esquema que contribuye a la identificación por distintos métodos estableciendo aquel más conveniente según la complejidad del laboratorio, permitió conocer la prevalencia de las especies en los diferentes procesos infecciosos y el comportamiento de aislamientos locales frente a diferentes agentes antimicrobianos. Verificamos que la resistencia antimicrobiana en el género es especie y método dependiente, particularmente frente a agentes betalactámicos