Estudios in silico de la expresión génica relativa a factores protectores frente al daño por frío en duraznos

El durazno es un fruto climatérico, por lo que es capaz de seguir madurando incluso separado de la planta. A pesar de que esta especie ha evolucionado a la abscisión natural, la cosecha implica un estrés que deja a la fruta a expensas de sus propias reservas. Sumados a los procesos biológicos internos, factores externos imperantes durante cada etapa productiva (incluidas las condiciones ambientales y las prácticas relativas a cultivo, cosecha y poscosecha), determinan la vida de estantería y la calidad organoléptica del fruto como alimento. Debido al rápido deterioro de los frutos a temperatura ambiente, la refrigeración se ha vuelto indispensable para lentificar la maduración manteniendo las propiedades alimenticias y organolépticas deseables, y a la vez extender la vida útil de la fruta. Sin embargo, dependiendo de la temperatura y duración del almacenamiento refrigerado, así como también de las condiciones precosecha, algunas variedades de duraznero se ven afectadas más que otras por una serie de desórdenes fisiológicos genéricamente englobados en la denominación daño por frío (chilling injury o CI). Estas afecciones comprometen la calidad de los duraznos como alimento. La harinosidad, por ejemplo, es un trastorno textural en la pulpa de la fruta que se manifiesta principalmente como pérdida de la jugosidad. No es posible detectarla en los frutos desde el exterior sin abrirlos y, al hacerlo, la falta de jugosidad produce una importante pérdida en el sabor debido a que vuelve a la pulpa pastosa y seca, generando insatisfacción en el consumidor. Han surgido numerosas estrategias, previas o simultáneas a la refrigeración, exitosas en la protección de la fruta frente al daño por frío. Se han estudiado almacenamientos en atmósferas controladas, tratamientos térmicos y adiciones de diferentes compuestos químicos al entorno de la fruta (Lurie y Crisosto, 2005). En particular, el tratamiento térmico a altas temperaturas previo a la refrigeración se ha demostrado útil para contrarrestar al daño por frío (y otras afecciones poscosecha) en frutos de variadas especies vegetales, modulando la velocidad de maduración, y preservando apariencia y propiedades nutricionales del alimento (Lurie, 1998). Pedreschi y Lurie (2015) revisan los diversos procesos biológicos de la fruta posiblemente afectados frente a estos cambios de temperatura; sin embargo, hasta el momento, se desconocen los mecanismos moleculares subyacentes de la protección así como del mismo daño por frío. En el presente trabajo final de la Especialización en Bioinformática, se considera que los efectos benéficos del tratamiento térmico frente al daño por frío podrían deberse (entre otros) a la modificación de las tasas de transcripción de los genes identificados, es de interés ahondar en el conocimiento de los requisitos moleculares que cada uno de ellos posee para su expresión génica a este nivel. Para ello, este trabajo propone la caracterización in silico de las secuencias upstream (promotores y 5’ UTRs) de genes con expresión génica diferencial frente al tratamiento térmico en duraznos. Estos estudios comprenden la detección y el análisis de la presencia de motivos lineales en las mencionadas secuencias, que podrían suponer sitios de unión funcionales para factores de transcripción de durazno, con roles importantes en los procesos biológicos de interés.