Klebsiella pneumoniae hipermucoviscosa: caracterización fenotípica y estudio de marcadores genéticos de hipervirulencia

Klebsiella es un género que incluye bacterias Gram negativas, anaerobias facultativas, que se aisló por primera vez a finales del siglo XIX y su nombre es en honor al microbiólogo alemán Edwin Klebs. Klebsiella se clasifica dentro de la familia Enterobacteriaceae la cual contiene una gran variedad de géneros considerados patógenos humanos, entre ellos, Salmonella, Yersinia, Serratia, Enterobacter, Citrobacter, Kluyvera, Leclercia, Raoultella, Cronobacter, entre otros. Al presente, el género Klebsiella comprende al menos 27 especies incluidas las pertenecientes al complejo de especies de K. pneumoniae (KpSC) y otras especies de Klebsiella (e.g. K. indica, K. terrigena, K. spallanzanii, K. huaxiensis, K. oxytoca, K. grimontii, K. pasteurii y K. michiganensis). La secuenciación del genoma completo, metodología de elección para definir una especie bacteriana, permitió identificar siete filogrupos que pertenecen a KpSC, incluidos K. pneumoniae, K. quasipneumoniae subesp. quasipneumoniae, K. quasipneumoniae subsp. similipneumoniae, K. variicola subsp. variicola, K. variicola subsp. tropica, K. quasivariicola y K. africana. Entre las especies del complejo, K. pneumoniae sensu stricto es la especie prevalente en muestras clínicas y normalmente comprende ~85% de los aislamientos identificados como K. pneumoniae (Kp). Todas las especies del complejo suelen ser erróneamente identificados como K. pneumoniae al utilizar métodos fenotípicos (pruebas bioquímicas) o proteómicos, debido a que poseen características similares. Alternativamente, la secuenciación de determinados genes housekeeping (e.g. gyrA) permiten también identificar las especies del complejo, no obstante, la secuenciación no es una metodología de rutina en el laboratorio clínico. Los métodos modernos de identificación bacteriana de especies incluyendo los secuenciadores y los espectrómetros de masa (MALDI-TOF) realizan análisis comparativos con genomas o cepas de referencia, y requieren bases de datos actualizadas para reflejar una taxonomía precisa. En Argentina, numerosas instituciones de salud han incorporado la técnica de MALDI-TOF al laboratorio clínico. Es así, que en el 2015 se creó la Red Nacional de Identificación Microbiológica por Espectrometría de Masas (RENAEM), la cual aporta actualizaciones para la identificación entre los que encuentra el género Klebsiella. Los estudios epidemiológicos en una población de aislamientos del complejo K. pneumoniae pueden realizarse por la metodología de secuenciación de múltiples alelos incluyendo el análisis filogenético de numerosos genes cromosomales (cgMLST, por core-genome multilocus sequence typing), o alternativamente de 7 genes housekeeping según el esquema propuesto por Pasteur. Estos análisis permiten definir sequenciotipos (ST) o clones, así como grupos clonales (CG) con ST estrechamente relacionados en estudios poblacionales. [...]